从最后一个型号B-52H开始，B-52将尾炮换装为一门20毫米M61A1型六管加特林航炮，备弹1200发，炮手可以在前部座舱内进行遥控射击。1994年，所有仍在役的B-52均将尾炮拆除，只保留了相应的武器接口。
