作为备用核反击指挥部,E-4B搭载有13套专用通信设备及46组天线,其中包括位于机背整流罩内的超高频卫星通信天线(可与部署在全球各地的美军指挥部进行通信)以及布置在机尾的可用绞盘收放的全长达8千米的超低频拖曳天线(用于同水下的战略核潜艇进行通信)。E-4B最多可搭载114名乘员。图为作战参谋室资料图,可见其搭载的电子设备均经过抗EMP攻击设计。